日本印刷产业从产业团体组织到印刷企业及其从业人员，往往都把绿色印刷摆在重要地位。日本印刷及其相关产业的行业组织比较健全，各种协会、学会、研究会、联合会等在行业发展过程中起着举足轻重的作用。鉴于日本印刷行业管理的特色，日本印刷产业环保事业的推进，除了国家层面的组织机构外，印刷产业组织机构无疑发挥了更加全面的作用。其中主要包括三大认证体系。

　　《企业社会责任（CRS）》认证体系。全日本印刷工业组合联合会从2010年开始筹备印刷企业《企业社会责任（CRS）》认证体系，成立了CRS推进专业委员会负责具体实施，2013年正式推出CRS认证体系，并于6月25日发布第一批40家获得认定的企业名单。

　　CRS认证的目的是推进其会员企业强化社会责任，从合规性、环境、信息安全、质量、雇佣关系/劳动安全、财务/业绩、社会贡献/地域指向、信息公开/交流等8个方面考核企业承担社会责任的具体措施，其中合规性、环境、信息安全3个方面是最重要的考核指标，实行一票否决制。CRS认证分为3个等级：1星为基本级，2星为较高级，3星为最高级。1星级认证主要是通过企业自主申报文件审查即可，2、3星则需要到企业现场审核。

　　《冰天使标志》环保印刷认证体系。日本推进印刷环境保护协会除了不断完善《冰天使标志》环保印刷认证体系之外，还在积极推进数码印刷认证、消减二氧化碳贡献度认证等。

　　目前，《冰天使标志》环保印刷认证体系仅针对轮转胶印和平张纸胶印，分别设有“银、金、金+”3个级别。《冰天使标志》认证手续非常简单，E3PA会员或准会员企业只要是按照《冰天使标志》环保印刷认证的标准生产的胶版印刷品，在《冰天使标志》环保印刷认证审查委员会备案后，都可以使用《冰天使标志》。

　　《绿色印刷标志》认证体系。日本印刷产业联合会从上世纪末就开始策划制定绿色印刷标准，并于2001年8月发布第一个绿色印刷标准《日印产联〈胶版印刷服务〉绿色标准》，此后，陆续推出各种印刷方式的绿色标准，并不断根据新的印刷环保要求加以修订完善。目前，日本印刷产业联合会的《绿色印刷标志》从标准到认证考核，再到评比颁奖，已经形成非常完整的、缜密的规范化体系。

　　日本印刷产业联合会的绿色印刷认证体系分成绿色印刷工厂认证、绿色印刷产品认证、绿色印刷器材认证等三大类。相应的《绿色印刷标志》分为1星、2星、3星共3个等级，星越多，则环保级别越高。

　　认证依据的标准又分为胶印服务、标签印刷服务、凹版印刷（软包装）服务、丝网印刷服务等4项，每项绿色标准都有配套的实施指南以及申请绿色认证的操作手册。以上四大绿色印刷标准最新修订版为2013年4月25日发布，同年10月25日开始实施。分别针对器材采购、印刷工艺和企业环保对策3个方面制定了相应的原则和标准。截至2013年7月，共有295家企业通过了日本印刷产业联合会的绿色印刷工厂认证，其中胶版印刷领域239家，凹版印刷领域39家，丝网印刷领域3家，标签印刷领域14家；共有24家印刷器材供应商的387类产品通过了绿色印刷器材认定。